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此处的核磁共振应该是指磁共振成像（MRI），MRI和CT的区别主要在于基本原理不同、检查优势不同、辐射影响不同、禁忌人群不同等。
1.基本原理不同
1）MRI是通过对静磁场中的人体施加某种特定频率的射频脉冲，使人体组织中的氢质子受到激励而发生磁共振现象，当终止射频脉冲后，质子在弛豫过程中感应出磁共振信号，经处理产生磁共振图像。
2）CT是用X线束对人体检查部位一定厚度的层面进行扫描，由探测器接收该层面上各个不同方向的人体组织对X线的衰减值，经模/数转换输入计算机，通过计算机处理后用黑白不同的灰度等级在荧光屏上显示出来，即构成CT图像。
2.检查优势不同
MRI图像对脑和软组织分辨率极佳，解剖结构和病变形态显示清楚，可以作为中枢神经系统以及关节内的病变的检查。而CT在临床上采用X射线断层扫描，显示小病灶及细微结构并重建成像，在组织密度分辨方面具有较大的优势，比如对分辨骨折、脑出血等比较便捷。
3.辐射影响不同
由于核磁共振利用磁场成像，不存在放射性，故对人体无害，是非常安全的一种检查手段。而CT是利用X线束成像，有放射伤害，但在人体可接受范围内。
4.禁忌人群不同
磁共振检查基于磁共振现象，无放射性，孕妇亦可进行该检查，但体内存在金属异物的检查者不可以进行该检查；而CT检查则是基于X线的检查项目，具有一定的放射性，孕妇禁止进行CT检查。
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